Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tfap2aP34056 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tfap2aP34056 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tfap2aP34056 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tfap2aP34056 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tfap2aP34056 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tfap2aP34056 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tfap2aP34056 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tfap2aP34056 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tfap2aP34056 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tfap2aP34056 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tfap2aP34056 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tfap2aP34056 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Tfap2aP34056 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tfap2aP34056 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tfap2aP34056 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tfap2aP34056 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms