Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifnar1P33896 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifnar1P33896 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.3 ms