Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc5P32043 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxc5P32043 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxc5P32043 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms