Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa2P31245 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxa2P31245 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxa2P31245 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms