Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd10P28359 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd10P28359 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd10P28359 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms