Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa5P28312 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa5P28312 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa5P28312 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa5P28312 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa5P28312 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa5P28312 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa5P28312 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa5P28312 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa5P28312 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms