Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aco1P28271 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aco1P28271 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aco1P28271 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aco1P28271 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aco1P28271 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aco1P28271 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aco1P28271 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aco1P28271 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aco1P28271 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Aco1P28271 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aco1P28271 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aco1P28271 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aco1P28271 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms