Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BrafP28028 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BrafP28028 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BrafP28028 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BrafP28028 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BrafP28028 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BrafP28028 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BrafP28028 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BrafP28028 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BrafP28028 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BrafP28028 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BrafP28028 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BrafP28028 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BrafP28028 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrafP28028 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrafP28028 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrafP28028 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrafP28028 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrafP28028 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrafP28028 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrafP28028 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrafP28028 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrafP28028 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrafP28028 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrafP28028 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrafP28028 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BrafP28028 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BrafP28028 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrafP28028 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrafP28028 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrafP28028 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrafP28028 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrafP28028 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrafP28028 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrafP28028 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BrafP28028 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrafP28028 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrafP28028 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrafP28028 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrafP28028 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrafP28028 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrafP28028 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BrafP28028 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BrafP28028 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BrafP28028 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BrafP28028 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BrafP28028 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BrafP28028 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BrafP28028 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BrafP28028 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BrafP28028 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BrafP28028 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BrafP28028 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BrafP28028 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BrafP28028 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BrafP28028 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BrafP28028 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BrafP28028 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BrafP28028 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BrafP28028 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BrafP28028 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BrafP28028 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BrafP28028 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BrafP28028 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BrafP28028 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BrafP28028 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BrafP28028 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BrafP28028 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BrafP28028 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BrafP28028 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BrafP28028 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BrafP28028 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BrafP28028 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BrafP28028 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BrafP28028 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BrafP28028 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BrafP28028 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BrafP28028 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BrafP28028 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BrafP28028 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BrafP28028 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BrafP28028 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BrafP28028 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BrafP28028 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BrafP28028 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BrafP28028 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BrafP28028 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BrafP28028 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BrafP28028 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BrafP28028 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BrafP28028 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BrafP28028 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BrafP28028 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BrafP28028 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BrafP28028 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BrafP28028 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BrafP28028 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BrafP28028 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BrafP28028 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BrafP28028 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms