Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav1P27870 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vav1P27870 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vav1P27870 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav1P27870 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vav1P27870 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vav1P27870 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vav1P27870 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Vav1P27870 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vav1P27870 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vav1P27870 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vav1P27870 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms