Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CenpbP27790 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CenpbP27790 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CenpbP27790 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CenpbP27790 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CenpbP27790 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CenpbP27790 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CenpbP27790 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CenpbP27790 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CenpbP27790 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CenpbP27790 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CenpbP27790 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CenpbP27790 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CenpbP27790 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CenpbP27790 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CenpbP27790 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CenpbP27790 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CenpbP27790 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CenpbP27790 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CenpbP27790 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CenpbP27790 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CenpbP27790 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CenpbP27790 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CenpbP27790 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CenpbP27790 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CenpbP27790 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CenpbP27790 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CenpbP27790 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CenpbP27790 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CenpbP27790 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms