Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af2P26369 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af2P26369 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af2P26369 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
U2af2P26369 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af2P26369 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af2P26369 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af2P26369 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af2P26369 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af2P26369 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af2P26369 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
U2af2P26369 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2af2P26369 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2af2P26369 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2af2P26369 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2af2P26369 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms