Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccnd1P25322 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccnd1P25322 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccnd1P25322 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccnd1P25322 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccnd1P25322 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccnd1P25322 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccnd1P25322 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccnd1P25322 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccnd1P25322 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccnd1P25322 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccnd1P25322 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms