Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NdnP25233 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NdnP25233 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NdnP25233 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NdnP25233 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NdnP25233 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NdnP25233 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NdnP25233 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NdnP25233 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NdnP25233 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NdnP25233 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NdnP25233 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NdnP25233 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NdnP25233 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NdnP25233 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NdnP25233 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NdnP25233 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NdnP25233 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NdnP25233 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NdnP25233 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NdnP25233 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NdnP25233 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NdnP25233 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NdnP25233 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NdnP25233 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NdnP25233 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NdnP25233 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NdnP25233 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NdnP25233 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NdnP25233 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NdnP25233 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NdnP25233 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NdnP25233 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NdnP25233 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NdnP25233 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NdnP25233 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NdnP25233 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NdnP25233 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NdnP25233 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NdnP25233 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NdnP25233 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NdnP25233 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NdnP25233 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NdnP25233 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NdnP25233 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NdnP25233 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NdnP25233 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NdnP25233 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NdnP25233 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NdnP25233 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NdnP25233 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NdnP25233 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NdnP25233 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NdnP25233 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NdnP25233 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NdnP25233 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NdnP25233 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NdnP25233 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NdnP25233 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NdnP25233 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NdnP25233 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NdnP25233 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NdnP25233 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NdnP25233 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NdnP25233 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NdnP25233 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NdnP25233 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NdnP25233 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NdnP25233 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NdnP25233 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NdnP25233 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NdnP25233 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NdnP25233 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NdnP25233 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NdnP25233 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NdnP25233 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NdnP25233 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NdnP25233 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NdnP25233 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NdnP25233 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NdnP25233 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NdnP25233 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NdnP25233 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NdnP25233 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NdnP25233 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NdnP25233 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NdnP25233 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NdnP25233 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NdnP25233 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NdnP25233 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NdnP25233 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NdnP25233 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NdnP25233 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NdnP25233 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NdnP25233 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NdnP25233 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NdnP25233 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NdnP25233 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NdnP25233 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NdnP25233 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms