Protein–RNA interactions for Protein: P23906

Irf2, Interferon regulatory factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2P23906 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf2P23906 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf2P23906 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf2P23906 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf2P23906 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf2P23906 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf2P23906 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf2P23906 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irf2P23906 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf2P23906 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf2P23906 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Irf2P23906 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms