Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd12P23812 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
Hoxd12P23812 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd12P23812 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms