Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata3P23772 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata3P23772 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata3P23772 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata3P23772 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata3P23772 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata3P23772 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata3P23772 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata3P23772 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata3P23772 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gata3P23772 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata3P23772 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata3P23772 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata3P23772 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata3P23772 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata3P23772 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata3P23772 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata3P23772 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata3P23772 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gata3P23772 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms