Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZfaP23607 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZfaP23607 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZfaP23607 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZfaP23607 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZfaP23607 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZfaP23607 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZfaP23607 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZfaP23607 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZfaP23607 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZfaP23607 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZfaP23607 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZfaP23607 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZfaP23607 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms