Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Clk1P22518 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clk1P22518 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Clk1P22518 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Clk1P22518 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk1P22518 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clk1P22518 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clk1P22518 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk1P22518 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clk1P22518 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clk1P22518 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clk1P22518 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clk1P22518 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Clk1P22518 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clk1P22518 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clk1P22518 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clk1P22518 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clk1P22518 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clk1P22518 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clk1P22518 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clk1P22518 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms