Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnnc2P20801 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnc2P20801 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnnc2P20801 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms