Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PdgfaP20033 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PdgfaP20033 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfaP20033 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms