Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl13aP19253 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13aP19253 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13aP19253 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13aP19253 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl13aP19253 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl13aP19253 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl13aP19253 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms