Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdc1P18828 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sdc1P18828 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sdc1P18828 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sdc1P18828 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sdc1P18828 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sdc1P18828 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc1P18828 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc1P18828 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc1P18828 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc1P18828 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc1P18828 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc1P18828 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc1P18828 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc1P18828 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc1P18828 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sdc1P18828 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sdc1P18828 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms