Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PcnaP17918 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PcnaP17918 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PcnaP17918 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PcnaP17918 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PcnaP17918 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PcnaP17918 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PcnaP17918 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PcnaP17918 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms