Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ass1P16460 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ass1P16460 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ass1P16460 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ass1P16460 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ass1P16460 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ass1P16460 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ass1P16460 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ass1P16460 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ass1P16460 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ass1P16460 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ass1P16460 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ass1P16460 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ass1P16460 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ass1P16460 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ass1P16460 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms