Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CnpP16330 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CnpP16330 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CnpP16330 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CnpP16330 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CnpP16330 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CnpP16330 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CnpP16330 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CnpP16330 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CnpP16330 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CnpP16330 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CnpP16330 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CnpP16330 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CnpP16330 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CnpP16330 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CnpP16330 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CnpP16330 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CnpP16330 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CnpP16330 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CnpP16330 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CnpP16330 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CnpP16330 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CnpP16330 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CnpP16330 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CnpP16330 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CnpP16330 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CnpP16330 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CnpP16330 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CnpP16330 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CnpP16330 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CnpP16330 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CnpP16330 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CnpP16330 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CnpP16330 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CnpP16330 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CnpP16330 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CnpP16330 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CnpP16330 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CnpP16330 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CnpP16330 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CnpP16330 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CnpP16330 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CnpP16330 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CnpP16330 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CnpP16330 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CnpP16330 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CnpP16330 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CnpP16330 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CnpP16330 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CnpP16330 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CnpP16330 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CnpP16330 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CnpP16330 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CnpP16330 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CnpP16330 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CnpP16330 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CnpP16330 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CnpP16330 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CnpP16330 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CnpP16330 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CnpP16330 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CnpP16330 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CnpP16330 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CnpP16330 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CnpP16330 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CnpP16330 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CnpP16330 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CnpP16330 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CnpP16330 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CnpP16330 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CnpP16330 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CnpP16330 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CnpP16330 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CnpP16330 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CnpP16330 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CnpP16330 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CnpP16330 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CnpP16330 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CnpP16330 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CnpP16330 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CnpP16330 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CnpP16330 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CnpP16330 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CnpP16330 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CnpP16330 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CnpP16330 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CnpP16330 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CnpP16330 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CnpP16330 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CnpP16330 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CnpP16330 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CnpP16330 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CnpP16330 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CnpP16330 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CnpP16330 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CnpP16330 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CnpP16330 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CnpP16330 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CnpP16330 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CnpP16330 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms