Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkceP16054 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrkceP16054 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkceP16054 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrkceP16054 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrkceP16054 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkceP16054 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkceP16054 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkceP16054 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrkceP16054 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkceP16054 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkceP16054 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkceP16054 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkceP16054 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms