Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rag1P15919 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rag1P15919 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rag1P15919 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rag1P15919 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rag1P15919 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rag1P15919 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rag1P15919 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rag1P15919 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rag1P15919 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rag1P15919 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms