Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Srp54P14576 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp54P14576 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp54P14576 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp54P14576 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp54P14576 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54P14576 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54P14576 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp54P14576 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srp54P14576 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp54P14576 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp54P14576 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srp54P14576 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms