Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Q9P14431 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Q9P14431 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms