Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrgnP13609 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrgnP13609 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrgnP13609 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SrgnP13609 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SrgnP13609 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrgnP13609 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrgnP13609 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrgnP13609 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrgnP13609 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrgnP13609 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrgnP13609 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrgnP13609 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrgnP13609 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrgnP13609 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SrgnP13609 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrgnP13609 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms