Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccl2P10148 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl2P10148 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms