Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl1P10146 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl1P10146 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl1P10146 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms