Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myod1P10085 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myod1P10085 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Myod1P10085 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Myod1P10085 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Myod1P10085 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Myod1P10085 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Myod1P10085 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myod1P10085 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Myod1P10085 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms