Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Surf1P09925 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Surf1P09925 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Surf1P09925 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Surf1P09925 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Surf1P09925 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Surf1P09925 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Surf1P09925 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Surf1P09925 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Surf1P09925 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Surf1P09925 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Surf1P09925 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms