Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxc9P09633 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxc9P09633 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxc9P09633 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms