Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa5P09021 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa5P09021 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa5P09021 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms