Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ifna5P07349 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifna5P07349 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms