Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtrP07309 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtrP07309 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtrP07309 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtrP07309 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TtrP07309 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtrP07309 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtrP07309 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtrP07309 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TtrP07309 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtrP07309 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtrP07309 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtrP07309 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtrP07309 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtrP07309 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtrP07309 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TtrP07309 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtrP07309 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtrP07309 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtrP07309 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtrP07309 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtrP07309 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtrP07309 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtrP07309 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtrP07309 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtrP07309 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtrP07309 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtrP07309 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtrP07309 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TtrP07309 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtrP07309 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtrP07309 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtrP07309 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtrP07309 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtrP07309 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtrP07309 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtrP07309 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtrP07309 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtrP07309 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtrP07309 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TtrP07309 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtrP07309 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtrP07309 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtrP07309 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtrP07309 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtrP07309 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtrP07309 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtrP07309 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtrP07309 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtrP07309 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtrP07309 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TtrP07309 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TtrP07309 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TtrP07309 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TtrP07309 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TtrP07309 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TtrP07309 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TtrP07309 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TtrP07309 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TtrP07309 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TtrP07309 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TtrP07309 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TtrP07309 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TtrP07309 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TtrP07309 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TtrP07309 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TtrP07309 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TtrP07309 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TtrP07309 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TtrP07309 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TtrP07309 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TtrP07309 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TtrP07309 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TtrP07309 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TtrP07309 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TtrP07309 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TtrP07309 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TtrP07309 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TtrP07309 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtrP07309 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TtrP07309 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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