Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprcP06800 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprcP06800 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprcP06800 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprcP06800 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprcP06800 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprcP06800 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprcP06800 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprcP06800 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprcP06800 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprcP06800 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprcP06800 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms