Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoa4P06728 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoa4P06728 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoa4P06728 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoa4P06728 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoa4P06728 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoa4P06728 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoa4P06728 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoa4P06728 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoa4P06728 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoa4P06728 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apoa4P06728 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apoa4P06728 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apoa4P06728 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apoa4P06728 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apoa4P06728 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoa4P06728 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoa4P06728 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms