Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Got1P05201 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Got1P05201 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Got1P05201 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Got1P05201 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Got1P05201 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Got1P05201 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Got1P05201 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Got1P05201 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Got1P05201 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Got1P05201 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Got1P05201 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Got1P05201 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Got1P05201 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Got1P05201 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Got1P05201 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Got1P05201 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Got1P05201 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Got1P05201 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Got1P05201 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Got1P05201 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Got1P05201 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Got1P05201 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Got1P05201 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Got1P05201 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Got1P05201 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Got1P05201 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Got1P05201 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Got1P05201 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Got1P05201 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Got1P05201 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Got1P05201 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Got1P05201 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Got1P05201 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Got1P05201 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Got1P05201 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Got1P05201 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Got1P05201 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Got1P05201 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Got1P05201 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Got1P05201 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Got1P05201 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Got1P05201 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Got1P05201 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Got1P05201 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Got1P05201 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Got1P05201 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Got1P05201 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Got1P05201 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Got1P05201 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Got1P05201 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Got1P05201 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Got1P05201 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Got1P05201 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Got1P05201 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Got1P05201 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Got1P05201 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Got1P05201 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Got1P05201 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Got1P05201 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Got1P05201 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Got1P05201 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Got1P05201 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Got1P05201 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Got1P05201 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Got1P05201 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Got1P05201 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Got1P05201 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Got1P05201 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Got1P05201 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Got1P05201 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Got1P05201 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Got1P05201 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Got1P05201 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Got1P05201 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Got1P05201 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Got1P05201 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Got1P05201 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Got1P05201 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Got1P05201 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Got1P05201 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Got1P05201 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Got1P05201 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Got1P05201 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Got1P05201 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Got1P05201 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Got1P05201 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Got1P05201 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Got1P05201 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Got1P05201 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Got1P05201 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Got1P05201 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Got1P05201 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Got1P05201 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Got1P05201 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Got1P05201 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Got1P05201 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Got1P05201 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Got1P05201 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Got1P05201 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms