Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxa7P02830 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxa7P02830 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hoxa7P02830 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxa7P02830 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms