Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01738 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01738 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01738 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01738 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01738 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01738 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01738 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01738 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01738 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01738 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01738 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01738 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01738 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01738 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01738 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01738 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01738 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01738 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01738 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01738 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01738 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01738 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01738 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01738 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01738 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01738 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01738 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01738 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01738 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01738 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01738 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01738 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01738 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01738 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01738 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01738 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01738 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01738 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01738 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01738 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01738 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01738 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01738 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01738 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01738 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01738 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01738 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01738 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01738 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01738 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01738 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01738 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01738 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01738 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01738 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01738 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01738 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01738 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01738 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01738 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01738 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01738 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01738 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01738 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01738 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01738 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01738 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01738 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01738 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01738 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01738 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01738 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01738 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01738 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01738 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01738 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01738 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01738 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01738 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01738 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01738 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01738 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01738 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01738 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01738 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01738 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01738 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01738 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01738 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01738 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01738 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01738 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01738 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01738 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01738 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01738 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01738 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01738 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01738 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms