Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01728 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01728 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01728 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01728 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01728 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01728 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01728 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01728 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01728 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01728 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01728 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01728 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01728 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01728 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01728 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01728 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01728 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01728 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01728 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01728 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01728 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01728 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01728 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01728 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01728 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01728 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01728 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01728 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01728 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01728 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01728 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01728 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01728 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01728 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01728 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01728 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01728 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01728 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01728 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01728 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01728 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01728 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01728 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01728 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01728 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01728 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01728 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01728 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01728 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01728 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01728 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01728 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01728 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01728 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01728 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01728 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01728 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01728 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01728 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01728 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01728 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01728 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01728 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01728 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01728 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01728 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01728 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01728 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01728 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01728 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01728 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01728 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01728 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01728 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01728 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01728 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01728 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
P01728 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01728 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01728 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01728 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01728 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01728 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01728 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01728 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01728 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01728 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01728 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01728 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01728 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01728 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01728 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01728 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01728 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01728 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01728 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01728 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01728 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01728 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms