Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01659 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01659 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01659 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01659 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01659 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01659 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01659 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01659 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01659 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01659 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01659 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01659 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01659 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01659 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01659 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01659 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01659 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01659 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01659 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01659 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01659 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01659 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01659 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01659 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01659 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01659 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01659 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01659 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01659 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01659 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01659 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01659 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01659 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01659 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01659 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01659 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01659 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01659 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01659 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01659 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01659 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01659 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01659 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01659 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01659 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01659 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01659 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01659 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01659 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01659 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01659 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01659 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01659 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01659 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01659 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01659 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01659 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01659 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01659 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01659 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01659 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01659 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01659 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01659 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01659 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01659 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01659 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01659 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01659 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01659 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01659 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01659 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01659 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01659 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01659 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01659 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01659 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01659 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01659 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01659 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01659 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01659 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01659 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01659 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01659 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01659 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01659 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01659 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01659 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01659 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01659 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01659 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01659 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01659 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01659 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01659 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01659 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01659 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01659 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms