Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01649 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01649 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01649 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01649 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01649 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01649 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01649 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01649 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01649 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01649 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01649 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01649 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01649 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01649 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01649 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01649 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01649 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01649 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01649 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01649 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01649 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01649 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01649 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01649 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01649 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01649 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01649 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01649 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01649 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01649 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01649 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01649 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
P01649 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01649 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01649 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01649 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01649 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01649 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01649 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
P01649 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01649 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01649 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01649 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01649 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01649 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01649 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01649 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01649 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01649 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01649 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
P01649 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
P01649 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01649 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
P01649 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01649 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01649 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01649 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01649 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01649 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01649 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01649 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01649 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01649 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01649 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01649 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01649 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01649 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01649 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01649 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01649 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01649 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01649 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01649 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01649 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
P01649 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
P01649 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01649 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01649 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01649 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01649 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01649 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01649 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01649 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01649 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01649 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01649 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01649 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01649 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01649 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01649 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01649 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01649 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01649 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01649 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01649 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01649 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01649 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01649 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01649 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms