Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abl1P00520 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abl1P00520 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abl1P00520 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abl1P00520 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abl1P00520 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abl1P00520 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abl1P00520 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abl1P00520 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Abl1P00520 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abl1P00520 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abl1P00520 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms