Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Apaf1O88879 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Apaf1O88879 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Apaf1O88879 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apaf1O88879 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms