Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sap30O88574 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap30O88574 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap30O88574 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sap30O88574 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap30O88574 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap30O88574 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap30O88574 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap30O88574 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap30O88574 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap30O88574 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sap30O88574 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sap30O88574 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms