Protein–RNA interactions for Protein: O88351

Ikbkb, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkbO88351 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IkbkbO88351 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IkbkbO88351 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IkbkbO88351 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IkbkbO88351 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IkbkbO88351 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IkbkbO88351 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IkbkbO88351 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IkbkbO88351 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IkbkbO88351 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IkbkbO88351 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms